- s -

• S() : VoxelPoolsBase
• scaleBufAndRates() : Neuron
• scaleBufsAndRates() : Stoich
• scaleHeadDiffusion() : Neuron
• scaleShaftDiffusion() : Neuron
• scaleVolsBufsRates() : VoxelPoolsBase
• SecondOrder() : SecondOrder
• selectGridSize() : CylBase
• selectGridVolume() : CylMesh
• selectPower() : HHChannel2D , HHChannelBase
• send() : SrcFinfo4< T1, T2, T3, T4 > , SrcFinfo5< T1, T2, T3, T4, T5 > , SrcFinfo6< T1, T2, T3, T4, T5, T6 > , SpikeGenStruct , SrcFinfo0 , SrcFinfo1< T > , SrcFinfo2< T1, T2 > , SrcFinfo3< T1, T2, T3 >
• sendBuffer() : SrcFinfo , SrcFinfo0 , SrcFinfo1< T > , SrcFinfo2< T1, T2 > , SrcFinfo3< T1, T2, T3 > , SrcFinfo4< T1, T2, T3, T4 > , SrcFinfo5< T1, T2, T3, T4, T5 > , SrcFinfo6< T1, T2, T3, T4, T5, T6 >
• sendProcessMsgs() : ChanCommon
• sendReinitMsgs() : ChanCommon
• sendTo() : SrcFinfo1< T > , SrcFinfo2< T1, T2 >
• sendVec() : SrcFinfo1< T >
• separateVols() : ReadKkit
• set() : FuncOrder , SetGet0 , SetGet1< A > , Field< A > , SetGet2< A1, A2 > , LookupField< L, A > , SetGet3< A1, A2, A3 > , SetGet4< A1, A2, A3, A4 > , SetGet5< A1, A2, A3, A4, A5 > , SetGet6< A1, A2, A3, A4, A5, A6 > , SparseMatrix< T >
• setA() : IzhikevichNrn
• setAbsoluteAccuracy() : MarkovGslSolver
• setAccommodating() : IzhikevichNrn
• setAlpha() : HHGate , IzhikevichNrn , GammaRng
• setAlwaysDiffuse() : CubeMesh
• setAngle() : Spine
• setB() : CaConcBase , IzhikevichNrn
• setBad() : SwcSegment
• setBaseLevel() : PulseGen
• setBeta() : HHGate , IzhikevichNrn
• setBindIndex() : SrcFinfo
• setBlock() : Gsolve , Ksolve , ZombiePoolInterface
• setC() : IzhikevichNrn
• setCa() : CaConcBase , HSolve , CaConcStruct
• setCaAdvance() : HSolve
• setCaBasal() : CaConcBase , HSolve , CaConcStruct
• setCaCeiling() : HSolve
• setCaDiv() : HSolve
• setCaFloor() : HSolve
• setCaMax() : HSolve
• setCaMin() : HSolve
• setCapacitance() : RC
• setCeiling() : CaConcBase
• setCeq() : DifShell
• setChannelDistribution() : Neuron
• setChildConcs() : ChemCompt
• setCin() : Nernst
• setCm() : moose::CompartmentBase , HSolve
• setCM() : Neuron
• setCMg() : MgBlock , NMDAChan
• setColor() : Annotator
• setCommand() : moose::VClamp , PIDController
• setCompartment() : Gsolve , Stoich , ZombiePoolInterface
• setCompartmentLengthInLambdas() : Neuron
• setConc() : PoolBase
• setConcInit() : PoolBase
• setConcK1() : CplxEnzBase
• setConcKb() : ReacBase
• setConcKf() : ReacBase
• setCondFraction() : NMDAChan
• setConst() : Function
• setConstantRate() : MarkovRateTable
• setConvergenceCriterion() : SteadyState
• setCoords() : CubeMesh , CylMesh
• setCount() : PulseGen
• setCout() : Nernst
• setCumulativeDistance() : SwcSegment
• setCwe() : Shell
• setD() : DifShell , IzhikevichNrn
• setDataSize() : LocalDataElement
• setDelay() : PulseGen
• setDia() : CylBase
• setDiameter() : CaConcBase , moose::CompartmentBase , DifShell
• setDiffConst() : PoolBase , Gsolve , Ksolve , VoxelPoolsBase , ZombiePoolInterface
• setDiffLength() : CylMesh , NeuroMesh
• setDiffScale() : CubeMesh
• setdirpath() : Annotator
• setDiv() : VectorTable
• setDivs() : HHGate
• setDoLoop() : StimulusTable
• setDsolve() : Gsolve , Ksolve , Stoich , ZombiePoolInterface
• setDt() : HSolve , Clock
• setDx() : Interpol2D , CubeMesh
• setDy() : Interpol2D , CubeMesh
• setDz() : CubeMesh
• setEdgeTriggered() : SpikeGen
• setEigenvalue() : SteadyState
• setEk() : ChanBase , HSolve
• setElist() : Stoich
• setEm() : moose::CompartmentBase , Neuron , HSolve
• setEntireVolume() : ChemCompt
• setEntry() : SparseMsg
• setEnzK1() : Stoich
• setEnzK2() : Stoich
• setEnzK3() : Stoich
• setEpsAbs() : Ksolve
• setEpsRel() : Ksolve
• setExpr() : Func , Function , FuncRate , FuncTerm , ZombieFunction
• setExtCa() : NMDAChan
• setFilename() : TimeTable
• setFirstDelay() : PulseGen
• setFirstLevel() : PulseGen
• setFirstWidth() : PulseGen
• setFloor() : CaConcBase
• setFuncArgIndex() : FuncRate
• setFunction() : Arith
• setFunctionExpr() : Stoich
• setGain() : moose::VClamp , DiffAmp , PIDController
• setGamma() : IzhikevichNrn
• setGatePower() : HHChannel , HHChannel2D
• setGbar() : ChanBase
• setGbars() : MarkovChannel
• setGeomAndElec() : moose::CompartmentBase
• setGeometricalDistanceFromSoma() : SwcSegment
• setGeometryPolicy() : NeuroMesh
• SetGet() : SetGet
• SetGet0() : SetGet0
• SetGet1() : SetGet1< A >
• SetGet2() : SetGet2< A1, A2 >
• SetGet3() : SetGet3< A1, A2, A3 >
• SetGet4() : SetGet4< A1, A2, A3, A4 >
• SetGet5() : SetGet5< A1, A2, A3, A4, A5 >
• SetGet6() : SetGet6< A1, A2, A3, A4, A5, A6 >
• setGk() : ChanBase , GapJunction , HSolve
• setHardware() : Shell
• setHeadDiameter() : Spine
• setHeadLength() : Spine
• setHHChannelGbar() : HSolve
• setHHmodulation() : HSolve
• setI1() : OneToAllMsg , SingleMsg
• setI2() : SingleMsg
• setIcon() : Annotator
• setId() : TestId
• setIdentifiedArg() : Arith
• setIk() : ChanBase
• setInclination() : Spine
• setIndependent() : Function
• setIndex() : OpFunc
• setInitDt() : VoxelPools
• setInitialState() : MarkovChannel , MarkovSolverBase
• setInitU() : IzhikevichNrn
• setInitVm() : moose::CompartmentBase , IzhikevichNrn , HSolve
• setInject() : moose::CompartmentBase , IzhikevichNrn , RC , HSolve
• setInjectMsg() : RC
• setInnerArea() : DifShell
• setInputOffset() : Adaptor
• setInstant() : HHChannel2D , HHChannelBase , HSolve
• setInt2dChildTable() : MarkovRateTable
• setIntCa() : NMDAChan
• setIntCaOffset() : NMDAChan
• setIntCaScale() : NMDAChan
• setInternalDt() : MarkovGslSolver
• setIsCylinder() : CylBase
• setIsToroid() : CubeMesh
• setJunctionVol() : CubeMesh
• setK() : ZeroOrder
• setK1() : CplxEnzBase
• setK2() : CplxEnzBase
• setKcat() : EnzBase , MMEnzymeBase
• setKm() : EnzBase , MMEnzymeBase
• setKMg_A() : MgBlock , NMDAChan
• setKMg_B() : MgBlock , NMDAChan
• setKsolve() : Stoich
• setLeak() : DifShell
• setLength() : CaConcBase , moose::CompartmentBase , DifShell , CylBase
• setLevel() : PulseGen
• setLigandConc() : MarkovChannel , MarkovRateTable
• setLigandGated() : MarkovChannel
• setLoopTime() : StimulusTable
• setMatrix() : SparseMsg
• setMax() : Uniform , UniformRng , HHGate , VectorTable
• setMaxIter() : SteadyState
• setMean() : ExponentialRng , Normal , NormalRng , Poisson , PoissonRng
• setMeshEntryVolume() : ChemCompt , PsdMesh , SpineMesh
• setMeshToSpace() : CubeMesh
• setMethod() : MarkovGslSolver , TimeTable , Cell , Ksolve , ChemCompt , ExponentialRng , Normal , NormalRng
• setMin() : HHGate , VectorTable , Uniform , UniformRng
• setMinfinity() : HHGate
• setMMenzKcat() : Stoich
• setMMenzKm() : Stoich
• setMode() : moose::VClamp , Func , Function
• setmodeltype() : Annotator
• setModulation() : ChanBase
• setMolN() : SteadyState
• setMolWt() : Species
• setMotorConst() : PoolBase , ZombiePoolInterface
• setMoveOntoCompartment() : ReadKkit
• setN() : PoolBase , Gsolve , Ksolve , VoxelPoolsBase , ZombiePoolInterface , BinomialRng
• setName() : Element , Neutral
• setNinit() : PoolBase , Gsolve , Ksolve , VoxelPoolsBase , ZombiePoolInterface
• setNormalizeWeights() : SynChan
• setNotes() : Annotator
• setNumAllVoxels() : Gsolve , Ksolve , ZombiePoolInterface
• setNumData() : Neutral
• setNumDivs() : CylBase
• setNumEntries() : ChemCompt
• setNumField() : FieldElementFinfoBase , FieldElementFinfo< T, F > , Neutral
• setNumFinfo() : Cinfo
• setNumGates() : HHChannel2D , HHChannelBase
• setNumKb() : ReacBase
• setNumKf() : ReacBase
• setNumKm() : EnzBase
• setNumOpenStates() : MarkovChannel
• setNumPools() : Gsolve , Ksolve , ZombiePoolInterface
• setNumReac() : GssaVoxelPools
• setNumSpines() : Neuron
• setNumStates() : MarkovChannel
• setNumVar() : Function
• setNvec() : Gsolve , Ksolve
• setNx() : CubeMesh
• setNy() : CubeMesh
• setNz() : CubeMesh
• setOneVoxelVolume() : ChemCompt
• setOneWay() : Stoich
• setOuterArea() : DifShell
• setOutput() : Arith
• setOutputOffset() : Adaptor
• setOutputValue() : TableBase
• setOwner() : InputVariable
• setP() : BinomialRng
• setParent() : SwcSegment , NeuroNode , SpineEntry
• setParentAndChildren() : NeuroNode
• setPassiveDistribution() : Neuron
• setPath() : HSolve , Stoich
• setPermeability() : NMDAChan
• setPhi() : Neuron
• setPowers() : HSolve , ChannelStruct
• setPreserveNumEntries() : CubeMesh
• setProbability() : SparseMsg
• setR0() : CylMesh
• setR1() : RateTerm , MMEnzymeBase , ExternReac , ZeroOrder , BidirectionalReaction , CylMesh
• setR2() : RateTerm , MMEnzymeBase , ExternReac , ZeroOrder , BidirectionalReaction
• setRa() : moose::CompartmentBase , HSolve
• setRA() : Neuron
• setRandInit() : Gsolve
• setRandomConnectivity() : SparseMsg
• setRate() : RandSpike
• setRates() : RateTerm , MMEnzymeBase , ExternReac , ZeroOrder , BidirectionalReaction
• setRatio() : CplxEnzBase
• setReacKb() : Stoich
• setReacKf() : Stoich
• setReactantIndex() : FuncTerm
• setReactants() : FuncRate , FuncReac
• setReflectivity() : Boundary
• setRefractoryPeriod() : IntFire
• setRefractT() : RandSpike , SpikeGen
• setRelativeAccuracy() : MarkovGslSolver
• setRepeat() : SetGet1< A > , Field< A > , LookupField< L, A >
• setResistance() : RC
• setRm() : moose::CompartmentBase , HSolve
• setRM() : Neuron
• setRmByTau() : IzhikevichNrn
• setRuntime() : Annotator
• setSaturation() : DiffAmp , PIDController
• setScale() : Nernst , Adaptor
• setSecondDelay() : PulseGen
• setSecondLevel() : PulseGen
• setSecondWidth() : PulseGen
• setSeed() : HSolve , SparseMsg
• setSensed() : PIDController
• setSeparateSpines() : NeuroMesh
• setShaftDiameter() : Spine
• setShaftLength() : Spine
• setShapeMode() : DifShell
• setShellElement() : Shell
• setSize() : SparseMatrix< T >
• setSolver() : EnzBase , ReacBase , ZombieEnz , ZombieFunction , ZombieMMenz , ZombieReac , Annotator
• setSolverClock() : Cell
• setSolverName() : Cell
• setSourceFile() : Neuron
• setSpaceToMesh() : CubeMesh
• setSpecies() : PoolBase , Stoich
• setSpineAndPsdDsolve() : Neuron
• setSpineAndPsdMesh() : Neuron
• setSpineDistribution() : Neuron
• setStartFid() : NeuroNode
• setStartTime() : StimulusTable
• setState() : MarkovChannel
• setStateLabels() : MarkovChannel
• setStencilSize() : MeshCompt
• setStepPosition() : StimulusTable
• setStepSize() : StimulusTable
• setStoich() : VoxelPools , Gsolve , GssaVoxelPools , Ksolve , SteadyState , ZombiePoolInterface
• setStopTime() : StimulusTable
• setStride() : DiagonalMsg
• setSubTree() : NeuroMesh
• setSubTreePath() : NeuroMesh
• setSurface() : CubeMesh
• setSy() : Interpol2D
• setTable() : VectorTable
• setTableA() : HHGate , HHGate2D
• setTableB() : HHGate2D , HHGate
• setTableValue() : Interpol2D
• setTableVector() : Interpol2D
• setTarget() : FuncTerm
• setTargetField() : SingleMsg
• setTau() : moose::VClamp , CaConcBase , HHGate , IntFire
• setTau1() : SynChan
• setTau2() : SynChan
• setTauB() : HSolve , CaConcStruct
• setTauD() : PIDController
• setTauI() : PIDController
• setTd() : moose::VClamp
• setTemperature() : Nernst , NMDAChan
• setTextColor() : Annotator
• setTheta() : GammaRng , Neuron
• setThickness() : CaConcBase , DifShell , PsdMesh
• setThis() : Mstring , Neutral
• setThresh() : IntFire
• setThreshold() : SpikeGen , SpikeStats , Table
• setTi() : moose::VClamp
• setTick() : Neutral , Element
• setTickDt() : Clock
• setTickStep() : Clock
• settle() : SteadyState
• settleFunc() : SteadyState
• setTotal() : SteadyState
• setTotalLength() : Spine
• setTrigMode() : PulseGen
• setU0() : IzhikevichNrn
• setup() : HinesMatrix , HSolveActive , HSolvePassive
• setupAlpha() : HHGate
• setupCrossSolverReacs() : ZombiePoolInterface
• setupCrossSolverReacVols() : Stoich , ZombiePoolInterface
• setupf() : Cell
• setupGate() : HHGate
• setupMatrix() : SteadyState
• setupSlaveMsg() : ReadKkit
• setupTables() : HHGate
• setupTau() : HHGate
• setupXfer() : Ksolve , ZombiePoolInterface
• setUseConcentration() : HHChannelBase , HHChannel2D
• setUseInterpolation() : HHGate
• setV0() : RC
• setValence() : Nernst , DifShell
• setValue() : Variable
• setVar() : Func , Function
• setVariance() : Normal , NormalRng
• setVarValues() : Function , Func
• setVDiv() : HSolve
• setVec() : LookupField< L, A > , SetGet2< A1, A2 > , SetGet1< A > , Field< A > , LookupField< L, A > , TableBase
• setVecSize() : TableBase
• setVin() : moose::VClamp
• setVm() : MarkovChannel , HSolve , IzhikevichNrn , MarkovRateTable , moose::CompartmentBase , IntFire
• setVm1() : GapJunction
• setVm2() : GapJunction
• setVMax() : HSolve
• setVmax() : IzhikevichNrn
• setVMin() : HSolve
• setVolume() : DifShell , PoolBase , VoxelPoolsBase , SpineEntry
• setVolumeAndDependencies() : GssaVoxelPools , VoxelPools , VoxelPoolsBase
• setVolumeNotRates() : ChemCompt
• setVtChildTable() : MarkovRateTable
• setWidth() : PulseGen
• setWindowLength() : Stats
• setX() : HHChannel2D , CylBase , Annotator , moose::CompartmentBase , HSolve , HHChannelBase , Func
• setX0() : CylMesh , CubeMesh , moose::CompartmentBase
• setX1() : CubeMesh , CylMesh
• setXdivs() : Interpol2D , MarkovSolverBase
• setXdivsA() : HHGate2D
• setXdivsB() : HHGate2D
• setXindex() : HHChannel2D
• setXmax() : MarkovSolverBase , Interpol , Interpol2D
• setXmaxA() : HHGate2D
• setXmaxB() : HHGate2D
• setXmin() : MarkovSolverBase , Interpol , Interpol2D
• setXminA() : HHGate2D
• setXminB() : HHGate2D
• setXpower() : HHChannelBase , HHChannel2D
• setXY() : Func
• setXYZ() : Func
• setY() : moose::CompartmentBase , HHChannelBase , Annotator , Func , HSolve , CylBase , HHChannel2D
• setY0() : moose::CompartmentBase , CylMesh , CubeMesh
• setY1() : CubeMesh , CylMesh
• setYdivs() : MarkovSolverBase , Interpol2D
• setYdivsA() : HHGate2D
• setYdivsB() : HHGate2D
• setYindex() : HHChannel2D
• setYmax() : Interpol2D , MarkovSolverBase
• setYmaxA() : HHGate2D
• setYmaxB() : HHGate2D
• setYmin() : Interpol2D , MarkovSolverBase
• setYminA() : HHGate2D
• setYminB() : HHGate2D
• setYpower() : HHChannel2D , HHChannelBase
• setZ() : Func , Annotator , HHChannel2D , HSolve , HHChannelBase , CylBase , moose::CompartmentBase
• setZ0() : moose::CompartmentBase , CubeMesh , CylMesh
• setZ1() : CubeMesh , CylMesh
• setZindex() : HHChannel2D
• setZk() : MgBlock
• setZpower() : HHChannelBase , HHChannel2D
• shaftId() : SpineEntry
• SharedFinfo() : SharedFinfo
• Shell() : Shell
• showFields() : Element
• showMatrices() : SteadyState
• showMatricesFunc() : SteadyState
• showMsg() : Element
• SingleMsg() : SingleMsg
• Sinit() : VoxelPoolsBase
• size() : Dinfo< D > , Conv< Id > , ZeroSizeDinfo< D > , Conv< double > , Conv< unsigned short > , Conv< vector< vector< T > > > , DinfoBase , PrepackedBuffer , Conv< unsigned int > , Conv< float > , Conv< int > , Conv< string > , HSolveUtils::Grid , VoxelPoolsBase , Conv< T > , Conv< short > , Conv< vector< T > > , Conv< bool >
• sizeIncrement() : DinfoBase , Dinfo< D > , ZeroSizeDinfo< D >
• solve() : HSolvePassive
• sources() : OneToOneMsg , Msg , DiagonalMsg , SparseMsg , SingleMsg , OneToAllMsg , OneToOneDataIndexMsg
• spaceToIndex() : CubeMesh
• SparseMatrix() : SparseMatrix< T >
• SparseMsg() : SparseMsg
• Species() : Species
• spike() : Table
• SpikeGen() : SpikeGen
• spikegens() : HSolveUtils
• SpikeGenStruct() : SpikeGenStruct
• SpikeRingBuffer() : SpikeRingBuffer
• SpikeStats() : SpikeStats
• Spine() : Spine
• SpineEntry() : SpineEntry
• spineIds() : Neuron
• SpineMesh() : SpineMesh
• spines() : SpineMesh
• src() : FinfoWrapper , SharedFinfo
• SrcFinfo() : SrcFinfo
• SrcFinfo0() : SrcFinfo0
• SrcFinfo1() : SrcFinfo1< T >
• SrcFinfo2() : SrcFinfo2< T1, T2 >
• SrcFinfo3() : SrcFinfo3< T1, T2, T3 >
• SrcFinfo4() : SrcFinfo4< T1, T2, T3, T4 >
• SrcFinfo5() : SrcFinfo5< T1, T2, T3, T4, T5 >
• SrcFinfo6() : SrcFinfo6< T1, T2, T3, T4, T5, T6 >
• srcFinfoName() : Cinfo
• start() : Shell
• startDataIndex() : GlobalDataElement , Element , FieldElement , MsgElement , LocalDataElement
• startFid() : NeuroNode
• Stats() : Stats
• SteadyState() : SteadyState
• Stencil() : Stencil
• step() : HSolveActive
• StimulusTable() : StimulusTable
• StochNOrder() : StochNOrder
• StochSecondOrderSingleSubstrate() : StochSecondOrderSingleSubstrate
• Stoich() : Stoich
• stop() : Clock
• storeInflux() : DifShell
• storeOutflux() : DifShell
• str2Id() : Id
• str2val() : Conv< float > , Conv< unsigned short > , Conv< short > , Conv< bool > , Conv< vector< vector< T > > > , Conv< string > , Conv< T > , Conv< int > , Conv< unsigned int > , Conv< double > , Conv< Id > , Conv< vector< T > >
• strGet() : FieldElementFinfoBase , ValueFinfo< T, F > , ReadOnlyLookupElementValueFinfo< T, L, F > , ReadOnlyValueFinfo< T, F > , LookupValueFinfo< T, L, F > , Finfo , SharedFinfo , DestFinfo , ReadOnlyLookupValueFinfo< T, L, F > , ElementValueFinfo< T, F > , ReadOnlyElementValueFinfo< T, F > , LookupElementValueFinfo< T, L, F > , SetGet , SrcFinfo
• strSet() : ReadOnlyLookupValueFinfo< T, L, F > , Finfo , ReadOnlyLookupElementValueFinfo< T, L, F > , LookupValueFinfo< T, L, F > , ReadOnlyValueFinfo< T, F > , DestFinfo , ValueFinfo< T, F > , SetGet , LookupElementValueFinfo< T, L, F > , SharedFinfo , SrcFinfo , ElementValueFinfo< T, F > , ReadOnlyElementValueFinfo< T, F > , FieldElementFinfoBase
• sub() : EnzBase , ReacBase
• sumRaxial() : SymCompartment
• surface() : CubeMesh
• Svec() : VoxelPoolsBase
• SwcBranch() : SwcBranch
• SwcSegment() : SwcSegment
• SymCompartment() : SymCompartment
• SynChan() : SynChan
• synchans() : HSolveUtils